Разворачивалась война с Англией. Риля вызвали в военное министерство, предложили заняться производством урана для уранового проекта. Скоро стало ясно, что на самом деле заказ имеет цель наладить получение урана для атомных бомб. Немцы, как известно, раньше американцев, начали работы над атомной бомбой. Семь с половиной тонн урана было произведено уже в 1942 году.
С 1942 года Риль стал собирать все запасы тория в оккупированных европейских странах. Это был реальный капитал, ценность которого понимали только осведомленные.
В берлинском бункере в конце января 1945 года принялись собирать большой реактор. Когда эксперимент, был подготовлен, поступило распоряжение об эвакуации. Ещё два-три дня, и эксперимент осуществился бы. Но этих дней не было.
Счёт пошел на часы. Обливаясь слезами, проклиная Гитлера и Советскую Армию, физики демонтировали реактор, не успев его испытать. 31 января груженые машины двинулись в Тюрингию. Из городка Штадтильм пришлось переезжать в Хейгерлох. В конце февраля группа Гейзенберга обосновалась и стала собирать в пещере Хейгерлоха новый котел. В последний день февраля котел запустили. Реакция не получилась. Гейзенберг подсчитал: надо добавить тяжелой воды и урана. Эти материалы были, но доставить их из-под Берлина оказалось невозможно. Опоздали. Германия агонизировала.
Ещё в сентябре 1944 г при бомбардировке Франкфурта сгорели заводы по очистке урана. Пробовали налаживать завод в Рейнсберге, не успели, подошли советские войска. Остались заводы в Ораниенбурге. Вместе с Бухом Ораниенбург должен был отойти в зону советских войск. Американцы прознали об атомных бомбах немцев и создали «Миссия Алсос», т е спецгруппа для захвата материалов, документов по атомной бомбе и ученых-физиков. Американцы боялись, чтобы все это не попало к русским. На Ораниенбург послали инженерную команду демонтировать урановый завод, захватить специалистов во главе с Н. Рилем. Были захвачены профессор Флейшман, специалист по разделению изотопов урана, и ещё семь физиков. Так же были «добыты» Отто Ган, Багге, Вайцзеккер, Дибнер, Лауэ и Гейзенберг. Война гналась за атомщиками. Немцы спохватились, но было поздно. История отомстила гитлеровцам за пренебрежение наукой, за презрение к высоколобым, за ненависть к интеллекту, к своей культуре.
Проникнуть в Ораниенбург не удалось. 15 марта шестьсот бомбардировщиков превратили город в руины. Уничтожено было все начисто.
Риль чудом выбрался из города и ушёл в Бух к Зубру. Американцы разрушили урановые заводы затем, чтобы они не достались русским. Для этого Ораниенбаум сравняли с землей. Получилось, что русские ещё воюют с фашистами, а американцы, союзники, тем временем воюют с русскими. Разве союзники так поступают?! Он повторял слова Ратенау о том, что если средства безнравственны, то и цель безнравственна.
Тем временем среди развалин Ораниенбурга Риля искали эсэсовские офицеры. Кого находили, тому приказывали отправляться на юг в «Альпийский редут». За неподчинение - расстрел. В «Альпийский редут» собирали конструкторов, связанных с проектом баллистических ракет, с производством Фау-2, стали собирать атомщиков, узнав, что за ними охотятся американцы. «Редут» помещался на стыке границ Германии, Австрии, Швейцарии.
Шла охота за мозгами - первая в истории охота такого рода.