На протяжении почти полутора лет царь, его жена и пятеро детей содержались сначала под арестом, а затем в заключении, в строгой изоляции. Они оставались во дворце лишь в первые месяцы революции. К тому времени, как власть оказалась в руках большевиков, они находились уже в Сибири, где до прибытия представителей Советов их жизнь, пусть и в отсутствие почти всех удобств, была сносной; то есть настолько, насколько может быть сносным существование людей, лишенных всего, в первую очередь, свободы. С приходом к власти большевистских комиссаров все изменилось. Условия содержания царской семьи стали более строгими; их подвергали постоянным унижениям и оскорблениям, не говоря уже о психологической жестокости, которая практиковалась ежечасно и граничила с настоящими пытками 2 . Последние месяцы жизни они провели в маленьком доме в Екатеринбурге, в котором им позволили занять всего две комнаты. В одной жили император, императрица и наследник, а во второй – четыре дочери. Двери комнат, выходившие в коридор, запрещалось закрывать даже ночью. В коридоре постоянно дежурили охранники, которые следили за каждым шагом узников.
Дом был окружен высоким деревянным забором, из-за которого невозможно было взглянуть на небо; в комнатах постоянно царил полумрак. Открывать окна запрещалось; узникам не позволяли ни дышать воздухом, ни делать упражнения. Скудно питаясь и подвергаясь систематическим унижениям, они давно оставили всякую надежду на счастливое окончание их страданий. Вдруг им сказали: из-за попытки их освободить их переводят в другое место.
Неизвестно, что они подумали об этой новости. Их привели в подвал. Императрица не могла стоять – неясно, из-за психического состояния или общего физического истощения. Император попросил для нее стул. Сам он стоял, держа сына на руках, так как мальчик, ослабленный из-за лишений, не мог ходить. Когда в подвал спустили всех членов семьи, их личного врача и слуг, в помещение вошли охранники, закрыли двери и расстреляли всех. Хотя последний этап мучений был кратким, не все жертвы погибли сразу.
В ходе следствия на том месте, где сжигали тела, нашли кости, остатки одежды и драгоценные камни. После тщательного изучения и идентификации было доказано, что останки принадлежат членам царской семьи и тем, кто погиб вместе с ними. Останки сложили в ящики и впоследствии переправили в Европу.
Тела погибших в Алапаевске извлекли из заброшенной угольной шахты. Их поместили в гробы и специальным поездом отправили в тыл. Усилиями родственников (Надежды Маунтбеттен, маркизы Милфорд-Хейвен, и ее брата, герцога Гессен-Дармштадтского) тела тети Эллы и погибшей вместе с ней монахини ее обители были отправлены в Иерусалим, где они сейчас покоятся. Останки других жертв, среди них Володи, поместили в церкви Русской православной миссии в Пекине. Следов еще одного члена семьи - великого князя Михаила, брата царя, – так и не нашли. Его вместе с его секретарем отправили в Сибирь примерно в то же время, что и других родственников, но держали отдельно. По слухам, большевики вывезли великого князя и его секретаря из дома, куда их поместили, и расстреляли в ближайшем лесу. Никаких следов обнаружить не удалось; великий князь Михаил и его спутник исчезли навсегда.